Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM43BQ6ZT52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM43BQ6ZT52 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM43BQ6ZT52 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM43BQ6ZT52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms