Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
UBR3Q6ZT12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
UBR3Q6ZT12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
UBR3Q6ZT12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBR3Q6ZT12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
UBR3Q6ZT12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBR3Q6ZT12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms