Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC36A4Q6YBV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC36A4Q6YBV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC36A4Q6YBV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC36A4Q6YBV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms