Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSTM1Q6UX27 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM1Q6UX27 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VSTM1Q6UX27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM1Q6UX27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms