Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO3Q6UWJ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMCO3Q6UWJ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms