Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LLGL2Q6P1M3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LLGL2Q6P1M3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LLGL2Q6P1M3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LLGL2Q6P1M3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LLGL2Q6P1M3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms