Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC8Q6NZY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC8Q6NZY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC8Q6NZY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms