Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGMBQ6NW40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGMBQ6NW40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGMBQ6NW40 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGMBQ6NW40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RGMBQ6NW40 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms