Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms