Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPH2Q6IBW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPH2Q6IBW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPH2Q6IBW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPH2Q6IBW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPH2Q6IBW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms