Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms