Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USPL1Q5W0Q7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USPL1Q5W0Q7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USPL1Q5W0Q7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms