Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM164Q5U3C3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM164Q5U3C3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM164Q5U3C3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms