Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGSNQ5TDP6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGSNQ5TDP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGSNQ5TDP6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms