Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEPDC1Q5TB30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC1Q5TB30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEPDC1Q5TB30 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1Q5TB30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms