Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF19Q5T6S3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF19Q5T6S3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF19Q5T6S3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms