Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SAMD9Q5K651 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
SAMD9Q5K651 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SAMD9Q5K651 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SAMD9Q5K651 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SAMD9Q5K651 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SAMD9Q5K651 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SAMD9Q5K651 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.69■■■■■ 4.11
SAMD9Q5K651 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SAMD9Q5K651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SAMD9Q5K651 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9Q5K651 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9Q5K651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SAMD9Q5K651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms