Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNNI3KQ59H18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TNNI3KQ59H18 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI3KQ59H18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI3KQ59H18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNNI3KQ59H18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNNI3KQ59H18 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms