Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms