Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01620Q4KN68 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01620Q4KN68 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms