Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC153Q494R4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC153Q494R4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC153Q494R4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms