Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM2Q2VYF4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM2Q2VYF4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LETM2Q2VYF4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM2Q2VYF4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM2Q2VYF4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM2Q2VYF4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM2Q2VYF4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM2Q2VYF4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM2Q2VYF4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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