Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPROQ16827 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPROQ16827 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPROQ16827 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPROQ16827 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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