Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXT1Q16394 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXT1Q16394 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT1Q16394 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXT1Q16394 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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