Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIP11Q15643 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIP11Q15643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIP11Q15643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIP11Q15643 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIP11Q15643 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIP11Q15643 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIP11Q15643 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP11Q15643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIP11Q15643 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP11Q15643 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP11Q15643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP11Q15643 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP11Q15643 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIP11Q15643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIP11Q15643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIP11Q15643 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIP11Q15643 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIP11Q15643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIP11Q15643 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIP11Q15643 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIP11Q15643 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms