Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGIF1Q15583 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGIF1Q15583 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGIF1Q15583 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGIF1Q15583 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms