Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF1Q15526 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF1Q15526 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF1Q15526 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF1Q15526 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF1Q15526 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF1Q15526 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF1Q15526 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SURF1Q15526 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SURF1Q15526 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SURF1Q15526 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF1Q15526 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF1Q15526 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF1Q15526 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF1Q15526 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF1Q15526 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF1Q15526 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF1Q15526 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF1Q15526 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF1Q15526 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF1Q15526 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SURF1Q15526 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF1Q15526 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SURF1Q15526 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SURF1Q15526 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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