Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYTH1Q15438 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYTH1Q15438 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CYTH1Q15438 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms