Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD6Q15008 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD6Q15008 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD6Q15008 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD6Q15008 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD6Q15008 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD6Q15008 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD6Q15008 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSMD6Q15008 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD6Q15008 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD6Q15008 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSMD6Q15008 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD6Q15008 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD6Q15008 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMD6Q15008 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms