Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NFIXQ14938 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NFIXQ14938 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIXQ14938 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIXQ14938 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFIXQ14938 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFIXQ14938 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NFIXQ14938 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NFIXQ14938 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
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