Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCD11Q14690 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD11Q14690 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCD11Q14690 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCD11Q14690 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms