Protein–RNA interactions for Protein: Q14679

TTLL4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, humanhuman

Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4Q14679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TTLL4Q14679 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTLL4Q14679 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTLL4Q14679 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL4Q14679 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL4Q14679 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL4Q14679 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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