Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EBI3Q14213 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EBI3Q14213 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBI3Q14213 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms