Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNGB1Q14028 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNGB1Q14028 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CNGB1Q14028 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CNGB1Q14028 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
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