Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFBQ13951 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFBQ13951 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFBQ13951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms