Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SQSTM1Q13501 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SQSTM1Q13501 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SQSTM1Q13501 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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