Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SF3B2Q13435 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SF3B2Q13435 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SF3B2Q13435 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SF3B2Q13435 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SF3B2Q13435 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SF3B2Q13435 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
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