Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB2Q13425 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB2Q13425 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNTB2Q13425 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNTB2Q13425 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTB2Q13425 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTB2Q13425 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms