Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTK7Q13308 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTK7Q13308 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTK7Q13308 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK7Q13308 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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