Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO2Q13137 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALCOCO2Q13137 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO2Q13137 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO2Q13137 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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