Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PRDM2Q13029 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PRDM2Q13029 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.7
PRDM2Q13029 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
PRDM2Q13029 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
PRDM2Q13029 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
PRDM2Q13029 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
PRDM2Q13029 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PRDM2Q13029 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
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