Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GRIK3Q13003 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK3Q13003 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK3Q13003 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK3Q13003 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK3Q13003 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK3Q13003 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK3Q13003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIK3Q13003 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK3Q13003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK3Q13003 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK3Q13003 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK3Q13003 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK3Q13003 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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