Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN31Q12999 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN31Q12999 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN31Q12999 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms