Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53BP1Q12888 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53BP1Q12888 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TP53BP1Q12888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53BP1Q12888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms