Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX10Q12887 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX10Q12887 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX10Q12887 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX10Q12887 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX10Q12887 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX10Q12887 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX10Q12887 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX10Q12887 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX10Q12887 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX10Q12887 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX10Q12887 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX10Q12887 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX10Q12887 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX10Q12887 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX10Q12887 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX10Q12887 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX10Q12887 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX10Q12887 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX10Q12887 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX10Q12887 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX10Q12887 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX10Q12887 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX10Q12887 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX10Q12887 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX10Q12887 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX10Q12887 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX10Q12887 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX10Q12887 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX10Q12887 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX10Q12887 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX10Q12887 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX10Q12887 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX10Q12887 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX10Q12887 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX10Q12887 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX10Q12887 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX10Q12887 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX10Q12887 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX10Q12887 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX10Q12887 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX10Q12887 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX10Q12887 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX10Q12887 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX10Q12887 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX10Q12887 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX10Q12887 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX10Q12887 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX10Q12887 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX10Q12887 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX10Q12887 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX10Q12887 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COX10Q12887 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX10Q12887 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX10Q12887 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX10Q12887 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX10Q12887 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX10Q12887 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX10Q12887 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX10Q12887 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX10Q12887 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX10Q12887 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX10Q12887 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COX10Q12887 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms