Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAPQ12770 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCAPQ12770 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAPQ12770 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPQ12770 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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