Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CGNL1Q0VF96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CGNL1Q0VF96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CGNL1Q0VF96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CGNL1Q0VF96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms