Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIRE1Q08AE8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIRE1Q08AE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIRE1Q08AE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIRE1Q08AE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPIRE1Q08AE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPIRE1Q08AE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPIRE1Q08AE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPIRE1Q08AE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPIRE1Q08AE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms