Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 TES1YJR019C 1050 nt7.91□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 CDA1YLR307W 906 nt7.9□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 AIM34YMR003W 597 nt7.9□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 PRE10YOR362C 867 nt7.9□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 HXT9YJL219W 1704 nt7.89□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 ADE2YOR128C 1716 nt7.89□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 SHC1YER096W 1539 nt7.89□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 PMT1YDL095W 2454 nt7.89□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 ELP6YMR312W 822 nt7.89□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 ARA2YMR041C 1008 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 LSP1YPL004C 1026 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 YPL108WYPL108W 507 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 AVL9YLR114C 2295 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 ITR1YDR497C 1755 nt7.87□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 PUS5YLR165C 765 nt7.87□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 TIM50YPL063W 1431 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 BEM1YBR200W 1656 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 ECM27YJR106W 2178 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 MTC6YHR151C 1581 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 PRC1YMR297W 1599 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 PMU1YKL128C 888 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 YER152CYER152C 1332 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 TOM20YGR082W 552 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 SPE4YLR146C 903 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 REG2YBR050C 1017 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 PEX28YHR150W 1740 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 MAM3YOL060C 2121 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 TPO1YLL028W 1761 nt7.84□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 SNU66YOR308C 1764 nt7.84□□□□□ -1.15
VHS3Q08438 KDX1YKL161C 1302 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 ARG7YMR062C 1326 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 RUP1YOR138C 2016 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 ATP10YLR393W 840 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 PDC5YLR134W 1692 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 GGC1YDL198C 903 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 SEN2YLR105C 1134 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 MNN9YPL050C 1188 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 FHN1YGR131W 525 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 YJL064WYJL064W 396 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 JHD1YER051W 1479 nt7.8□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 PAU19YMR325W 375 nt7.79□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 FRT1YOR324C 1809 nt7.79□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 YPR084WYPR084W 1371 nt7.79□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 NDE1YMR145C 1683 nt7.79□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 TOP3YLR234W 1971 nt7.79□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 NAP1YKR048C 1254 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 YLR030WYLR030W 792 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 YMR206WYMR206W 942 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 AOS1YPR180W 1044 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS3Q08438 HAM1YJR069C 594 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 PET10YKR046C 852 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 SNF7YLR025W 723 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 ERG6YML008C 1152 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 BXI1YNL305C 894 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 CHA1YCL064C 1083 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 GNA1YFL017C 480 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 YHR033WYHR033W 1272 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 RCF2YNR018W 675 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 YER156CYER156C 1017 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 DST1YGL043W 930 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 FCY1YPR062W 477 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 LEO1YOR123C 1395 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 MAL31YBR298C 1845 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 CPR2YHR057C 618 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 ERR3YMR323W 1314 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 ERR1YOR393W 1314 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 ERR2YPL281C 1314 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 HDA1YNL021W 2121 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 RPS6AYPL090C 711 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 RPS6BYBR181C 711 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 ATP2YJR121W 1536 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 BNS1YGR230W 414 nt7.72□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 REC114YMR133W 1287 nt7.72□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 CTF3YLR381W 2202 nt7.71□□□□□ -1.17
VHS3Q08438 SNA3YJL151C 402 nt7.71□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.71□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 SWM1YDR260C 513 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 ATG17YLR423C 1254 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 RTC2YBR147W 891 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 PMA2YPL036W 2844 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 PET18YCR020C 648 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YJL160CYJL160C 864 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YOR041CYOR041C 432 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YKR023WYKR023W 1593 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YBL113CYBL113C 2379 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YCP4YCR004C 744 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 CAR2YLR438W 1275 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YMR007WYMR007W 381 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 DCR2YLR361C 1737 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 ATG22YCL038C 1587 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 MFT1YML062C 1179 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 YMR253CYMR253C 1245 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS3Q08438 IDP3YNL009W 1263 nt7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms