Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL1Q08397 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LOXL1Q08397 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL1Q08397 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL1Q08397 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms